Viruskultur und Virusnachweis

In-vitro-Infektionsmodelle (S2/L2-Bereiche)

Mit unseren Infektionsmodellen können Sie Ihre antiviralen und antibakteriellen Moleküle im Modell testen und ihre Wirkweise untersuchen.  

• Herpes simplex virus Typ 1 / 2, Varicella Zoster Virus (VZV), Epstein Barr Virus (EBV), Adenoviren, Lentiviren, respiratorische Viren (Rhinoviren HRV, Coronaviren HCoV 229E, Influenza, RSV), diverse Sars-CoV-2-Surrogat-Viren
• Bakteriophagen und diverse Bakterien (E. coli, S. aureus (MRSA), Legionellen, Acinetobacter, Xylella fastidiosa etc.)

Virus-Genom-Engineering  

Wir engineeren Viren (Herpesviren) und Bakteriophagen zielgerichtet mithilfe modernster Methoden.

• Bacterial artificial chromosome (BAC) technology (bacterial genetics)
• CRISPR/Cas9
• Zell- und Gentherapie, onkolytische Viren, Impfstoffe (ATMPs)
• Rekombinante Phagen (Designer-Phagen)

Charakterisierung von Viren, viralen Vektoren und Bakteriophagen

Wir analysieren Viren hinsichtlich

• Stabilität von formulierten therapeutischen Viren
• Stabilität in Aerosolen (Aerosol-Erzeugung, Sampling, Nachweis)
• Abreicherung bzw. Inaktivierung durch Luftreiniger
• Abreicherung bzw.  Inaktivierung bei der Wasseraufbereitung
• Virus-Material-Wechselwirkung
• Virus-Wirts-Interaktionen

Zur Charakterisierung der Viren an unterschiedlichen Grenzflächen und in diversen Medien steht eine Reihe virologischer, molekularbiologischer und zellbiologischer Methoden zur Verfügung:

Virus-Aktivität

• Viraler Plaque-Assay
• TCID50 Assay
• Analyse der Wachstumskinetik
• ELISA

Nachweis und Quantifizierung viraler Genome

• Bioanalyzer
• PCR, RT-qPCR
• DNA-Arrays,
  
• Lateral Flow Assay

Zellbiologische Analyse

• Indirekte Immunfluoreszenzanalyse
• Konfokalmikroskopie
• Transmissionselektronenmikroskopie (TEM)

Virus-Diagnostik

Wir unterstützen Sie bei der Diagnostik von Viren mit gängigen molekularbiologischen Methoden.

• Virusdiagnostik (PCR, qPCR, RT-qPCR, Bioanalyzer, DNA- und Protein-Microarrays und ELISA)
• Differenzierung von bakteriellen, viralen und fungalen Erkrankungen

Produktion von Viren und Bakteriophagen

Folgende Viren und Bakteriophagen können neben Virus-like particles im L2/S2-Bereich produziert, konzentriert und gereinigt werden: Herpes simplex virus Typ 1 / 2, Varicella Zoster Virus (VZV), Epstein Barr Virus (EBV), Adenoviren, Lentiviren, respiratorische Viren (Rhinoviren HRV, Coronaviren HCoV 229E, Influenza, RSV), diverse Sars-CoV-2-Surrogat-Viren, Phi6, MS2

• Virusproduktion im Labormaßstab
• Herstellung von Virus-like particles (VLPs)
• Virologische, biochemische und molekularbiologische Analytik
  • Virus-Aktivitätsnachweise (s.o.)
  • Molekularbiologische Analytik (s.o.)
  • Zellbiologische Charakterisierung (s.o.)
    
  • Biochemische Charakterisierung
    • Biochemische Zusammensetzung
    • Modifikation
    • Enzymatische Aktivität
    • Protein-Wechselwirkung (Hefe-2-Hybridsystem, Lumier- und BRET-Assay)
• Konzentrierung und Reindarstellung (u. a. Chromatografie, Ultrazentrifuge)

Herstellung von pharmazeutischen, infektionsmodulierenden Enzymen

• Expression
• Enzymatische Aktivität
• Aufreinigung
• Charakterisierung

Lieber, D.; Bailer S. M. (2013)
Determination of HSV-1 infectivity by plaque assay and a luciferase reporter cell line
Methods Mol Biol. 1064: 171-181. doi: 10.1007/978-1-62703-601-6_12.

Striebinger, H.; Koegl, M.; Bailer, S. M. (2013)
A high-throughput yeast two-hybrid protocol to determine virus-host protein interactions
Methods Mol Biol. 1064: 1-15. doi: 10.1007/978-1-62703-601-6_1.

Lenac Roviš, T.; Bailer, S. M.; Pothineni, V. R.; Ouwendijk, W. J.; Šimić, H., Babić, M.; Miklić, K.; Malić, S.; Verweij, M. C.; Baiker, A.; Gonzalez, O.; von Brunn, A.; Zimmer, R.; Früh, K.; Verjans, G. M., Jonjić, S; Haas, J. (2013)
Comprehensive analysis of varicella-zoster virus proteins using a new monoclonal antibody collection
J Virol. 87(12): 6943-6954. doi: 10.1128/JVI.00407-13.