Array-Technologien

• Sepsis
  
• Respiratorische Erkrankungen
• Hautinfektionen
• Sexuell übertragbare Erkrankungen
• Resistenznachweis
• Gemischte Panels mit Bakterien, Pilzen, Protozoen und Viren

• Kundenspezifische DNA-Microarrays
• DNA-Sondendesign
• Spotting
• Hybridisierung von Target-DNAs
• Signalauswertung

Automatisierte Herstellung von Microarrays mit einem Spotter.

Das Fraunhofer IGB entwickelt für Kunden aus Unternehmen, Kliniken und Forschungseinrichtungen individuelle Microarrays mit maßgeschneiderten Erregerpanels.

Die vorhandene Infrastruktur ermöglicht es, individuell angepasste Microarrays vom Design der Sonden bis hin zu deren Immobilisierung mittels Kontaktprintverfahren zu entwickeln.

1. Lagorce, A., Hauser, N. C., Labourdette, D., Rodriguez, C., Martin-Yken, H., Arroyo, J., Hoheisel, J. D., and Francois, J. (2003) Genome-wide analysis of the response to cell wall mutations in the yeast Saccharomyces cerevisiae, J Biol Chem 278, 20345-20357.
2. Sohn, K., Urban, C., Brunner, H., and Rupp, S. (2003) EFG1 is a major regulator of cell wall dynamics in Candida albicans as revealed by DNA microarrays, Mol Microbiol 47, 89-102.
3. Lotz, H., Sohn, K., Brunner, H., Muhlschlegel, F. A., and Rupp, S. (2004) RBR1, a novel pH-regulated cell wall gene of Candida albicans, is repressed by RIM101 and activated by NRG1, Eukaryot Cell 3, 776-784.
4. Fellenberg, K., Busold, C. H., Witt, O., Bauer, A., Beckmann, B., Hauser, N. C., Frohme, M., Winter, S., Dippon, J., and Hoheisel, J. D. (2006) Systematic interpretation of microarray data using experiment annotations, BMC Genomics 7, 319.
5. Hauser, N. C., Martinez, R., Jacob, A., Rupp, S., Hoheisel, J. D., and Matysiak, S. (2006) Utilising the left-helical conformation of L-DNA for analysing different marker types on a single universal microarray platform, Nucleic Acids Res 34, 5101-5111.
6. Sohn, K., Senyurek, I., Fertey, J., Konigsdorfer, A., Joffroy, C., Hauser, N., Zelt, G., Brunner, H., and Rupp, S. (2006) An in vitro assay to study the transcriptional response during adherence of Candida albicans to different human epithelia, FEMS Yeast Res 6, 1085-1093.
7. Wilson, D., Tutulan-Cunita, A., Jung, W., Hauser, N. C., Hernandez, R., Williamson, T., Piekarska, K., Rupp, S., Young, T., and Stateva, L. (2007) Deletion of the high-affinity cAMP phosphodiesterase encoded by PDE2 affects stress responses and virulence in Candida albicans, Mol Microbiol 65, 841-856.
8. Hauser, N. C., Dukalska, M., Fellenberg, K., and Rupp, S. (2009) From experimental setup to data analysis in transcriptomics: copper metabolism in the human pathogen Candida albicans, J Biophotonics 2, 262-268.
9. Hartmann, S. C., Kumar, Y., Lemuth, K., Rohde, B., Knabbe, C., Weile, J., Bauser, C., Hauser, N. C., Schöck, U., and Rupp, S. (2010) Schnelle molekulare Sepsis-Diagnostik - Ein Biochip für die schnelle Pathogenidentifizierung und Resistenzcharakterisierung, In GIT Labor-Fachzeitschrift, pp 824-825.
10. Dally, S., Lemuth, K., Kaase, M., Rupp, S., Knabbe, C., Weile, J. (2013) DNA-microarray for genotyping antibiotic resistance determinants in Acinetobacter baumannii clinical isolates. Antimicrob. Agents Chemother. 57, 4761–4768.